version: 3.0

DNC HMM

This is the highly conserved motif described by Carrasco et al. (2005)

CLUSTAL W(1.4) multiple sequence alignment


BE493868/1-60   FLPNVRSGGWSDIG
AL822602/1-60   FLPNVRSGGWSDIG
CA019985/1-60   FLPSVRSGGWSDIG
BF258447/1-60   FVPTIRSGDWSDIG
BQ608630/1-60   FVPAIRSGDWSDIG
CB654058/1-62   FVPVIRSGDWSDIG
BG560423/1-62   FVPVIRSGDWSDIG
CF071658/1-61   FVPFIRSGDWSDIG
AP003019/1-73   FVPNIRSGDWSDIG
BJ554393/1-89   FLPALRSGEWSDIG
CF211377/1-65   FVPALRSGEWSDIG
BG133234/1-94   FLPVLRSGDWSDIG
BG351439/1-94   FLPVLRSGDWSDIG
BM064889/1-69   FLPTLRSGDWSDIG
AF520810/1-94   FLPTLRSGEWSDIG
BU003887/1-70   FTPMLRSGEWSDIG
BG452220/1-93   FVPTLRSGXWSDIG
CA838286/1-110  FLPILRSGEWSDIG